ブラウザに画像を送信するのではなくファイルに保存する場合は、Graph::Stroke() メソッドで絶対ファイル名を指定します。
$graph->Stroke("/usr/home/peter/images/result2002.png");
この場合、指定したディレクトリに Apache/PHP がファイルを作成する権限があることを確認してください。
また、ファイル名には特別な意味を表す 2 種類の文字列が定義されています。
$handle = $graph->Stroke(_IMG_HANDLER);